PIM606 Jmol

  1. Jmol is ein Computerprogramm, welches dreidimensionale Darstellungen von Molekülmodellen auf html-Seiten erlaubt. Es ist der Nachfolger des mdl-chime plug-Ins (PIM441). Es ist jedoch "open source", Plug-In frei, kostenlos verfügbar und bietet mehr Möglichkeiten.
  2. Bezugsquelle ist http://jmol.sourceforge.net (mit Demonstrationsscript). Es gibt eine stand-alone Anwendung für die Moleküldarstellung auf dem eigenen Computer, sowie eine Webvariante für die Einbettung in Web-seiten.
  3. Jmol interactive scripting documentation, wo die Befehle zur Manipulation von Molekülen beschrieben werden.
  4. Jmol Documentation (für die "alte" version; Jmol 9).
  5. Jmol.js JavaScript Library mit welcher die Moleküle in html-Seiten eingebettet und gesteuert werden. Der Link enthält gute Einführung zu Jmol und Erklärung der einzlenen Befehle.
  6. Beispiel für ein kleines Molekül z.B. NADH und für ein Protein mit einer Liste von eigenen Standardscripts für die Proteindarstellung.
  7. Weitere (und schönere) Beispiele für Jmol Darstellungen finden sich auf meiner blueTB Website.